新城疫病毒P/V/W基因编码产物功能结构域的分析及定位

• 作者: 丁铲 于圣青 于洋 仇旭升 孟春春 陈鸿军
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 医学
• 关键词: 新城疫病毒 P蛋白 V蛋白 生物信息学 功能结构城
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 191-196,207
• 分类号: R3
• 字数: 5115字
• 语种: 中文

摘要

NDV的P基因能够通过RNA编辑机制编码3种病毒蛋白P,V和W.为了初步确定新城疫病毒P、V和W的功能结构域及其在P基因中位置,对这3种具有相同N端不同C端的病毒蛋白进行生物信息学分析.分别设计针对基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅶ型以及class I NDV毒株P基因的引物.RT-PCR获得5种基因型NDV P基因的正确序列.通过核苷酸序列预测P基因表达产物的氨基酸序列,并进行二级结构预测和三级结构模拟.将SV5 V蛋白空间结构作为模板,从而分析获得了NDVP/V/W基因编码产物的二级结构以及部分空间结构.综合各种分析数据,预测P蛋白辅助N蛋白折叠的结构域位于N端前50 aa内;介导P蛋白四聚体形成的coiled-coil结构位于221-290 aa范围内;介导P蛋白与基因组的作用的X结构城位于291-392 aas范围内.V蛋白的C端结构域的编码区域位于P蛋白132-239 aa编码区域内.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁铲	中国农业科学院上海兽医研究所	95	454	11.0	16.0
2	于圣青	中国农业科学院上海兽医研究所	53	286	9.0	14.0
3	于洋	中国农业科学院上海兽医研究所	19	173	7.0	13.0
4	孟春春	中国农业科学院上海兽医研究所	21	62	5.0	6.0
6	仇旭升	中国农业科学院上海兽医研究所	36	114	7.0	8.0
8	陈鸿军	中国农业科学院上海兽医研究所	57	114	6.0	8.0