基于SMP集群的激光化学反应模拟效率分析

• 作者: 唐红 孙世新 李鸿健 豆育升
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 激光化学反应 半经典分子动力学 SMP集群 加速比 并行效率
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 1232-1234,1241
• 分类号: TP338
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.04.007

摘要

基于半经典分子动力学模型,在SMP集群中实现激光化学反应双层并行模拟系统.结合粗粒度的原子分解算法和细粒度的矩阵并行乘法实现激光化学反应模拟中力计算部分的并行化,分析粒度划分对半经典分子动力学模拟并行效率的影响.在SMP集群中测试表明,采用128个处理器模拟由500个C原子构成的分子体系,并行效率可达70%.在CPU数量固定的情况下,SMP节点内的细粒度的并行对提高半经典分子动力学模拟并行效率影响较大.该系统能够模拟大分子体系的激光化学反应,在提高加速比的同时保证计算资源的利用效率,满足激光化学反应模拟需求.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙世新	电子科技大学计算机科学与工程学院	141	955	16.0	22.0
2	唐红	重庆邮电大学计算机科学与技术学院	103	746	13.0	22.0
3	李鸿健	电子科技大学计算机科学与工程学院	18	131	7.0	10.0
5	豆育升	重庆邮电大学计算机科学与技术学院	24	125	6.0	10.0