根据转基因水稻中外源基因Cry1A(B)和内源基因SPS设计SYBR Green I引物、TaqMan引物和荧光探针,以内源基因SPS作为内参照,使用两种FQ-PCR方法对水稻深加工产品中转基因水稻的含量进行定量检测.建立了转基因水稻标准品Cry1A(B)和SPS之间的△Ct与样品中转基因水稻含量百分比之间的校正曲线和线性回归方程,并对4种未知水稻深加工样品进行检测,同时比较两者的检测结果.结果表明,TaqMan和SYBR Green I两种荧光定量PCR检测技术的检测结果可靠,且均可用于转基因深加工产品的检测.