苦荞中查尔酮合成酶全长基因的克隆及其序列分析

• 作者: 于寒松 刘凯 王冠 胡耀辉
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苦荞 查尔酮合成酶 RACE 内含子 进化树
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 65-68,72
• 分类号: Q78
• 字数: 3403字
• 语种: 中文

摘要

选用乌克兰伊琳娜苦荞为试验材料,以从叶片中提取的RNA为模板,应用RACE技术结合CODEHOP引物设计方法成功克隆出苦荞中查尔酮合成酶cDNA序列后,将其序列电子合并其全长后设计基因全长特异性引物.以DNA为模板进行PCR扩增出基因序列.通过生物信息学分析表明,该基因金长为1 906 bp,具有一个463 bp的内含子序列,编码区长度为1188 bp,编码395个氨基酸.Blastn序列比对发现本试验所获得的CHS基因序列与相近物种Rheum palmatum(登录号:DQ205352.1)的CHS基因同源性达86％.将得到的序列命名为RaCHS并提交GenBank,登录号为HQ434624.应用Clustalxl.81和MEGA4软件构建系统进化树,并进行了同源性分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡耀辉	吉林农业大学食品科学与工程学院	121	1061	16.0	26.0
2	于寒松	吉林农业大学食品科学与工程学院	89	334	9.0	14.0
3	王冠	吉林农业大学生命科学学院	5	10	3.0	3.0
4	刘凯	吉林农业大学食品科学与工程学院和吉林省农业综合开发办公室	1	3	1.0	1.0