麝香百合液泡膜水孔蛋白基因LlTIP2的克隆及生物信息学分析

• 作者: 丁岳炼 何生根 李红梅 林燕飞 陈伟文 黄新敏
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 麝香百合 水孔蛋白 液泡膜内在蛋白 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用与组织培养
• 页码范围: 1868-1872
• 分类号: S681
• 字数: 3784字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2011.10.016

摘要

水孔蛋白是位于质膜和液泡膜等生物膜上主要负责水分跨膜运输的通道蛋白,属于膜主要内在蛋白(major intrinsic proteins,MIP)超家族.采用RT-PCR和RACE法从麝香百合(Lilium longiflorum)叶片克隆得到1个液泡膜内在蛋白(tonoplast intrinsic proteins,TIPs)基因的全长cDNA序列,命名为LTIP2(GenBank登录号:JN085950).该基因cDNA全长986 bp,包括208bp的3’-非翻译区,744 bp开放阅读框以及34 bp的5’-非翻译区,共编码247个氨基酸.由L1TI P2推导的氨基酸序列具有2个高度保守的水孔蛋白NPA (Asn-Pro-Ala)基序以及MIP的特征序列SGGHVNPAVTFG.同源性分析表明,LITIP2氨基酸序列与陆地棉(Gossypium hirsutum)、大麦(Hordeum vulgare)、黑麦草(Lolium perenne)和小麦(Triticum aestivum)等植物TIP2的同源性分别达77％、74％、73％和72％.系统进化树分析表明LlTIP2属于液泡膜水孔蛋白TIP2亚类新成员.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何生根	仲恺农业工程学院生命科学学院	72	625	13.0	21.0
2	黄新敏	仲恺农业工程学院生命科学学院	13	92	6.0	9.0
3	李红梅	仲恺农业工程学院生命科学学院	26	123	7.0	9.0
4	林燕飞	仲恺农业工程学院生命科学学院	4	37	4.0	4.0
5	陈伟文	仲恺农业工程学院生命科学学院	2	7	2.0	2.0
6	丁岳炼	仲恺农业工程学院生命科学学院	2	15	2.0	2.0