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纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析
纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析
作者:
何永睿
刘小丰
姚利晓
彭爱红
许兰珍
陈善春
雷天刚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
柑橘
果实
枯水
抑制性差减杂交
EST
摘要:
为分析柑橘果实贮藏过程中枯水相关特异基因的表达情况,以纽荷尔脐橙(Citrus Sinensis Osbeck)采摘后贮藏至略见枯水果实的果肉为测验方(Tester),以刚采摘果实的果肉为驱动方(Driver),采用抑制性差减杂交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)技术成功构建了贮藏果实差减cDNA 文库,共获得656个阳性克隆.随机挑取克隆进行菌液PCR分析,插入片段长度主要集中在100~1 000bp.成功对213个克隆进行测序,获得有效序列143条,经序列分析,共得到53条uniESTs序列.在NCBI基因库中对这53个uniESTs进行BLAST分析,比对结果参照MIPS的分类标准,按功能分为14类,其中参与代谢、能量及蛋白合成的ESTs最多,分别占到了全部ESTs的17%、11%和13%.
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文献信息
篇名
纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析
来源期刊
园艺学报
学科
农学
关键词
柑橘
果实
枯水
抑制性差减杂交
EST
年,卷(期)
2011,(6)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1153-1160
页数
分类号
S666
字数
语种
中文
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抑制性差减杂交
EST
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
园艺学报
主办单位:
中国园艺学会
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0513-353X
CN:
11-1924/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
82-471
创刊时间:
1962
语种:
chi
出版文献量(篇)
6617
总下载数(次)
13
总被引数(次)
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