利用Affymetrix芯片分析民猪冷应激后肌肉组织的基因表达谱

• 作者: 何鑫淼 刘娣 别墅 孙洪涛 张冬杰 汪亮 王文涛
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 民猪 冷应激 基因芯片 Real-time PCR
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1661-1665
• 分类号: S828|S813.3
• 字数: 2920字
• 语种: 中文

摘要

冷应激可引起动物生产性能下降,诱发多种疾病,甚至造成死亡.民猪是我国北部地区特有的一个抗寒品种,为了研究冷应激下基因的表达调控机制,本研究利用Affymetrix猪基因芯片对民猪冷应激后肌肉组织内表达发生变化的基因进行了高通量的检测.结果,共检测到差异基因34个,其中下调表达的基因27个,上调表达的基因7个.在下调表达的基因中有7个(OAS1、IRG6、ISG20、DDX58、IFITl、ISG15、CXCL9)与干扰素诱导相关,1个(FST)与生长性状相关,2个(MX1、PG-2)与抗病毒有关,2个(S100A9、Numb)与细胞生长和凋亡有关；上调表达的基因功能还不清楚,推测它们可能与提高机体的抗寒性有关.对其中5个基因进行了Real-time PCR分析,证实它们都受到了温度的调节,与芯片检测结果吻合.结果提示,重度冷应激会造成机体免疫力下降,生长减缓.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘娣		251	803	12.0	15.0
2	何鑫淼		52	53	4.0	5.0
3	王文涛		77	68	5.0	5.0
4	张冬杰		87	157	6.0	7.0
5	孙洪涛		11	27	3.0	4.0
6	汪亮		52	117	6.0	7.0
7	别墅		6	11	2.0	3.0