两个油菜品系的fad2和sad基因序列差异比较

• 作者: 张洁夫 戚存扣 浦惠明 胡茂龙 陈松 高建芹 龙卫华
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 油菜 油酸含量 fad2基因 sad基因 克隆
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·耕作栽培·生理生化
• 页码范围: 1203-1209
• 分类号: S565.4
• 字数: 5384字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2011.06.007

摘要

以来源相同而油酸含量差异显著的两个甘蓝型油菜DH品系WH141和WH149为研究材料克隆了与油酸含量相关的两个关键基因fad2(脂肪酸脱氢酶基因)和sad(硬脂酰ACP脱氢酶基因),并对克隆序列多次测序,利用DNAman软件分析两个基因序列差异.结果表明:①以fad2基因序列中的6个连续变异碱基为依据可将该基因分为2类,AF型和AY型.两者均存在于WH141和WH149品系中.AF型序列内两品系共有3处有义突变,但两品系对应氨基酸的出现频率有明显差异,说明相应fad2基因的拷贝数在两品系中有较大差异.另外,在氨基酸序列中第241位疏水氨基酸F变异为极性氨基酸Y,可能对该基因的功能有较大影响.AY型序列内,除了单碱基变异外,还存在小片段的插入缺失.单碱基变异大部分对应翻译不同种类的氨基酸.片段的插入缺失导致多个读码框出现,比较后发现WH141和WH149有3个相同的读码框,而且在WH149中发现还有2个可能的fad2基因特异表达框.②对比两品系sad基因的外显子序列后发现,WH141和WH149存在14个位点的单碱基变异,且绝大部分变异位点编码的氨基酸发生了改变.