人PSF蛋白结合长非编码RNA的筛选及鉴定

• 作者: 兰洋 刘涛 李灵 王慧娟
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 人PSF蛋白 长非编码RNA RNA亲和层析
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 910-916
• 分类号: Q522
• 字数: 3904字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2011.04.035

摘要

通过RNA亲和层析(RNA affinity chromatograph),4种可能与人PSF(human polypyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor,hPSF)蛋白结合的长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)片段在人黑色素瘤细胞yusac细胞核RNA文库中被筛选得到.它们分别定位于人内源性逆转座子L1PA16、MER 11C、非编码基因MALAT-1以及一个未知基因(unknown gene).紫外交联分析(UV cross-linking assay)证明在体外条件下这4种lncRNA片段均能与PSF蛋白结合；RNA免疫沉淀(RNA immunoprecipitation,RNA-IP)进一步证实在体内条件下这4种lncRNA均能与hPSF发生相互作用.最后,半定量RT-PCR表明,未知lncRNA特异高表达于人黑色素瘤细胞,其余3种lncRNA在多种人类肿瘤细胞中的丰度均较正常细胞明显升高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘涛	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	82	496	12.0	19.0
2	王慧娟	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	11	14	2.0	3.0
3	兰洋	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	14	52	4.0	7.0
4	李灵	四川大学生命科学学院功能基因组实验室	23	107	6.0	10.0