玉米寡肽转运蛋白基因(ZmOPT0212)的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 刘海军 张祖新 祝丽英 赵永锋 陈景堂 高慧 黄亚群
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 玉米 寡肽转运蛋白(OPT) 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 99-104
• 分类号: Q78
• 字数: 4790字
• 语种: 中文

摘要

根据玉米B73和水稻的寡肽转运蛋白全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从玉米自交系478中克隆到了寡肽转运蛋白基因,命名为ZmOPT0212(Accession number:HM021150).ZmOPT0212开放阅读框为2 151 bp,编码716个氨基酸残基,等电点8.87,相对分子质量为77.4 kDa.预测由该基因转录的寡肽转运蛋白其二级结构约含43.85%的α-螺旋、13.27%的延伸链、3.91%的β-转角和38.97%的不规则卷曲,含有14个连续的疏水片断,其中12个可能构成跨膜螺旋;预测该转运蛋白不存在信号肽,亚细胞定位存在于细胞膜上.同源性和进化树的预测分析显示,ZmOPT0212蛋白与水稻、拟南芥、毛果杨和蓖麻等高等植物的寡肽转运蛋白同源性分别达到了99%,96%,92%和92%,所转运的底物除有寡肽外,还包含有金属离子、金属离子-烟草胺的螯合物等.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈景堂	河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心	62	926	19.0	27.0
2	祝丽英	河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心	47	712	16.0	25.0
3	黄亚群	河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心	33	413	12.0	19.0
4	赵永锋	河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心	12	195	6.0	12.0
5	高慧	河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心	3	34	2.0	3.0
6	刘海军	河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心	3	24	2.0	3.0