玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析

• 作者: 吴子恺 宋燕春 王天宇 石云素 程伟东 谭贤杰 黎裕
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: Rubisco活化酶(RCA) 单核苷酸多态性(SNP) InDe1 连锁不平衡(LD) 单倍犁 单倍型标签SNP
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 58-66
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2011.00058

摘要

Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率.为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680bp的基因组序列.多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDe1,其中5个SNP和1个InDe1变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型.ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴子恺	广西大学农学院	100	956	14.0	26.0
2	黎裕	中国农业科学院作物科学研究所	86	3342	29.0	56.0
3	王天宇	中国农业科学院作物科学研究所	92	3270	28.0	55.0
4	石云素	中国农业科学院作物科学研究所	57	1473	24.0	36.0
5	宋燕春	中国农业科学院作物科学研究所	50	1298	22.0	35.0
6	程伟东	广西大学农学院	5	39	4.0	5.0
7	谭贤杰	广西大学农学院	7	186	5.0	7.0