28株隐球菌ITS基因序列测定及其系统进化分析

• 作者: 卢金星 吴媛 杜鹏程
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 隐球菌 转录间隔区 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 92-95
• 分类号: R515
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2011.02.004

摘要

目的 测定28株鸽粪中分离的隐球菌的转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,并根据ITS序列构建28株隐球菌和6株新牛隐球菌的系统进化树.方法 应用neighbor-joining(NJ)和maximum parsimony(MP)方法构建系统进化树,研究隐球菌属不同菌种间的亲缘和进化分化关系.结果 两种聚类方法得到的进化树模型基本一致,所有菌株聚类为3个主要分支:6株分离到的新生隐球菌和6株参考菌株为一支;大部分DHP和XSQ菌株聚为一支,除HP6外,所有的HP菌株和XSQ46-1及XSQ59-3,聚类为平行的第3个分支.从分化远近看,新生隐球菌分支、DHP和XSQ分支的分化年代没有显著差异.结论 隐球菌属中,所有的新生隐球菌聚类为一支,其余的隐球菌菌种均分散在不同分支中,没有明显的种属聚集性,即呈现了隐球菌属不均一的特性.