4种葡萄类病毒检测及序列分析

• 作者: 任芳 张尊平 范旭东 董雅凤
• 来源期刊: 中外葡萄与葡萄酒
• 学科: 农学
• 关键词: 萄萄类病毒 RT-PCR检测 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 13-17
• 分类号: S436.631.1
• 字数: 3752字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-7360.2011.05.003

摘要

采用苹果锈果类病毒属(Apscaviroid)保守区域设计的通用引物和4种葡萄类病毒特异引物,对采自辽宁、山东、新疆、甘肃和宁夏的48个葡萄样品进行RT-PCR检测及序列分析.结果表明,葡萄黄斑类病毒1(Grapevine yellow speckle viroid l,GYSVdl),葡萄黄斑类病毒2 (Grapevine yellow speckle viroid2,GYSVd2)、澳大利亚葡萄类病毒(Australian grapevine viroid,AGVd)和啤酒花矮化类病毒(Hop stuntviroid,HSVd)检出率分别为41.7%,22.9%,75%和83.3%.通用引物能够检测出大部分样品中的GYSVdl,GYSVd2,AGVd.序列分析结果显示,中国辽宁兴城GYSVdl分离物(GU 170805)属于Type I,与澳大利亚Type I分离物同源性为99%,与澳大利亚及日本Type II 分离物同源性为97%,与中国GYSVd3分离物及美国、日本Type III分离物同源性仅为89%,而与GYSVd2分离物同源性均在80%以下.GYSVd2扩增产物(HM211853)与其余分离物的相似性在97%以上,与两个北京分离物DQ377131和DQ377129最为相似,相似性为99%.辽宁AGVd分离物(HM211854)与其他分离物同源性都在97%以上.山东HSVd分离物(HM357802)与北京、日本葡萄分离物的同源性均在98%以上,与德国萄萄分离物同源性为97%,与马铃薯、啤酒花、柑橘等其他作物上的分离物同源性为97%以下.