中蜂囊状幼虫病毒结构蛋白预测与鉴定

• 作者: 李明 程健 谢振声 费东亮 马臣 马鸣潇
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中蜂囊状幼虫病毒 反转录聚合酶链反应 结构蛋白 质谱分析
• 年，卷（期）: 2011,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1768-1773
• 分类号: O629|S895.1+33
• 字数: 3714字
• 语种: 中文

摘要

采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法、生物信息学软件和质谱分析对中蜂囊状幼虫病毒(CSBV)辽宁株(CSBV-LN)全基时组进行了分子克隆、序列测定、分子生物学特性分析及结构蛋白预测和鉴定.结果表明,CSBV-LN全基因组序列长度为8863个核苷酸,编码一个大的开放阅读框,其中包括178 nt的5′非编码区的前导序列和79 nt的3′非编码区,后面跟着一个poly(A)的尾巴,通过软件分析表明,CSBV-LN蛋白序列类似于哺乳动物的小RNA病毒蛋白序列,预计存在VP1,VP2,VP3和VP4等4个小的结构蛋白;系统进化分析表明,CSBV、囊状幼虫病毒(SBV)和残翅病毒(DWV)的起源相同,推测CSBV有着类似DWV的结构蛋白序列5′-VP2-VP4VP1VP3-3.基于此,根据PAGE蛋白条带的大小,利用NetPicoRNA软件预测结构蛋白的裂解位点.在此基础上,对纯化后的CSBV进行SDS-PAGE分离,对分离到的4个蛋白进行质谱分析,结果鉴定出VP1,VP3和VP0 3个蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	费东亮	辽宁医学院实验动物中心	48	134	6.0	8.0
2	马鸣潇	辽宁医学院实验动物中心	20	70	4.0	7.0
3	李明	辽宁医学院实验动物中心	29	138	8.0	11.0
4	程健	辽宁医学院实验动物中心	4	23	3.0	4.0