脉冲场凝胶电泳和自动化核糖体分型方法用于霍乱弧菌分子分型能力的比较

• 作者: 刁保卫 周海健 张力 章丽娟 逄波 阚飙 韩辉
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 脉冲场凝胶电泳 自动化核糖体分型 分子分型 霍乱弧菌
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 325-327,333
• 分类号: R516.5
• 语种: 中文

摘要

目的 比较脉冲场凝胶电泳(17FGE)和自动化核糖体分型两种方法对霍乱弧菌的分型能力.方法 应用PFGE和自动化核糖体分型分析254株01群和37株0139群霍乱弧菌,比较两种方法的分型力、分辨力和对暴发菌株的分析能力.结果 PFGE将254株01群和37株0139菌株分别分为211和21个型别,分型D值分别为0.9952和0.9339;自动化核糖体分型将同样的菌株分为101和10个型别,分型D值分别为0.9075和0.8033.PFGE和自动化核糖体分型均可以区分01群霍乱的暴发相关和不相关菌株.PFGE能够将不同起0139暴发来源的菌株分开,同时将相同暴发来源的菌株分为相同的型别;自动化核糖体分型不能完全区分不同起0139暴发来源的菌株,也不能将同起0139霍乱暴发来源的菌株分为相同的型别.结论 在霍乱弧菌分型方面,PFGE和自动化核糖体分型方法均具有相同的分型力,但PFGE具有更高的分辨力和更好的暴发菌株分析能力.自动化核糖体分型方法在霍乱暴发调查中具有局限性,更适合用于菌株鉴定.