2007-2009年广西壮族自治区甲3亚型流感病毒HA1基因变异的特征研究

• 作者: 居昱 康宁 潘浩 谭毅 闭福银 韦增良
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 甲3亚型流感病毒 HA1基因 变异
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 278-283
• 分类号: RS11.7
• 语种: 中文

摘要

目的 从HA1基因层面探讨2007-2009年广西壮族自治区(广西)甲3流感病毒的变异、进化发展规律,探寻与WHO疫苗推荐株以及上海市、北京市和浙江省等地当年流行株之间的差异.方法 提取广西22株2007-2009年甲3流感毒株RNA,并测定其血凝素重链(HA1)区域的核苷酸序列,采用生物信息软件,分析与当年疫苗推荐株及上海、北京和浙江等地在HA1以及HAI抗原决定簇区域的差异,分析进化关系.结果 22株广西甲3流感病毒2007年与2008年比较接近,HA1区核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为99.39%和99.08%;而与2009年变异较大,同源性均值分别为99.04%和97.78%.而对比世界卫生组织(WHO)推荐的2008-2009年甲3流感疫苗株A/Brisbane/10/2007,广西3年分离株HA1区氨基酸酸同源性均值分别为99.81%、99.25%和97.94%.2009年广西甲3流感病毒与当年疫苗株比较,HA1抗原决定簇发生了6个氨基酸的替换,且发生在A、D、E三区.各年度散发株和暴发株同源性较均在99.00%以上.2007年广西甲3毒株与上海及北京比,HA1区氨基酸同源性均值分别为99.83%和99.12%,2008年比较结果分别为98.93%和99.25%.基因进化树分析显示2009年分离株与2007年、2008年及当年疫苗株距离较远,单独分支.结论 广西2007年与2008年甲3流感病毒HA1基因特性较为接近,2009年毒株发生了较大变异.广西与上海、浙江等地分离株更为接近,而与北京分离株差异较大.WHO推荐的当年疫苗株均滞后广西流行株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭毅		131	911	16.0	23.0
2	闭福银		53	383	11.0	16.0
3	康宁		21	135	8.0	10.0
4	居昱		18	235	9.0	15.0
5	韦增良		21	122	7.0	9.0
6	潘浩		43	440	12.0	20.0