东北雅罗鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析

• 作者: 刘春雷 刘金亮 常玉梅 徐丽华 柳玉海 梁利群 韩国苍 高玉奎
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 东北雅罗鱼 微卫星 磁珠富集
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 87-93
• 分类号: Q78
• 字数: 5830字
• 语种: 中文

摘要

通过磁珠富集法筛选东北雅罗鱼的微卫星分子标记.采用限制性内切酶Sau 3AI对东北雅罗鱼基因组DNA进行酶切,选取400～900 bp的片段进行PCR全基因组扩增,并利用生物素标记的(CAG)8、(TGA)8、(AGAT)6、(GATT)6 4个探针进行微卫星片段的富集.将得到的片段与T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后以SaulA为引物对长出的菌落进行PCR扩增,挑取扩增后片段大小符合条件的菌落送生物公司测序.结果表明:1 416个阳性克隆中有1 047个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列,完美型占67.99%,非完美型为15.31%;混合性标记占16.70%.从中选出160个微卫星序列设计105对引物并合成,经过筛选,56对引物可扩增出清晰条带,其中23对具有多态性.选取18对多态性引物对达里湖东北雅罗鱼群体进行扩增,结果显示等位基因数为3～11,多态信息含量(PIC)为0.207 7～0.882 0,67%(12对/18对)的位点处于高度多态水平(PIC>0.5).