银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

• 作者: 付茵茵 张倩 李际红 王聪聪 邢世岩
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 银杏 表观遗传学 DNA甲基化 MSAP
• 年，卷（期）: 2011,（8）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 1429-1436
• 分类号: S664.3
• 字数: 4721字
• 语种: 中文

摘要

利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性（methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP）分析体系,在全基因组水平检测银杏DNA甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示,从54对MSAP选扩引物中,选出16对MSAP引物组合,共扩增产生454条清晰可辨且可重复的DNA条带,平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中,检测到甲基化位点200个,CCGG/GGCC位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组DNA序列。BLASTn比对分析表明,银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在DNA甲基化修饰现象。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢世岩	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	151	1426	20.0	27.0
2	李际红	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	53	559	12.0	21.0
3	张倩	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	30	101	5.0	8.0
4	付茵茵	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	2	34	1.0	2.0
5	王聪聪	山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室	5	48	3.0	5.0