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银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析
银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析
作者:
付茵茵
张倩
李际红
王聪聪
邢世岩
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
银杏
表观遗传学
DNA甲基化
MSAP
摘要:
利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析体系,在全基因组水平检测银杏DNA甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示,从54对MSAP选扩引物中,选出16对MSAP引物组合,共扩增产生454条清晰可辨且可重复的DNA条带,平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中,检测到甲基化位点200个,CCGG/GGCC位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组DNA序列。BLASTn比对分析表明,银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在DNA甲基化修饰现象。
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文献信息
篇名
银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析
来源期刊
园艺学报
学科
农学
关键词
银杏
表观遗传学
DNA甲基化
MSAP
年,卷(期)
2011,(8)
所属期刊栏目
果树
研究方向
页码范围
1429-1436
页数
分类号
S664.3
字数
4721字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
邢世岩
山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室
151
1426
20.0
27.0
2
李际红
山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室
53
559
12.0
21.0
3
张倩
山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室
30
101
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8.0
4
付茵茵
山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室
2
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王聪聪
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主办单位:
中国园艺学会
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0513-353X
CN:
11-1924/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
82-471
创刊时间:
1962
语种:
chi
出版文献量(篇)
6617
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13
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