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摘要:
利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析体系,在全基因组水平检测银杏DNA甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示,从54对MSAP选扩引物中,选出16对MSAP引物组合,共扩增产生454条清晰可辨且可重复的DNA条带,平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中,检测到甲基化位点200个,CCGG/GGCC位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组DNA序列。BLASTn比对分析表明,银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在DNA甲基化修饰现象。
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文献信息
篇名 银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析
来源期刊 园艺学报 学科 农学
关键词 银杏 表观遗传学 DNA甲基化 MSAP
年,卷(期) 2011,(8) 所属期刊栏目 果树
研究方向 页码范围 1429-1436
页数 分类号 S664.3
字数 4721字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 邢世岩 山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室 151 1426 20.0 27.0
2 李际红 山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室 53 559 12.0 21.0
3 张倩 山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室 30 101 5.0 8.0
4 付茵茵 山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室 2 34 1.0 2.0
5 王聪聪 山东农业大学林学院农业生态与环境重点实验室 5 48 3.0 5.0
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园艺学报
月刊
0513-353X
11-1924/S
大16开
北京中关村南大街12号
82-471
1962
chi
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