植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析

• 作者: 孙君社 孙立伟 张秀清 王波 翟玉盼
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物Ⅲ型聚酮合酶 序列比对 分子进化
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 83-89,94
• 分类号: Q94
• 字数: 5578字
• 语种: 中文

摘要

Ⅲ型聚酮合酶(type Ⅲ polyketide synthase,PKSⅢ)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料.为了进一步了解植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,选取了75条来自不同植物物种包括苔藓类植物、蕨类植物、裸子植物、单子叶植物和双子叶植物的PKSⅢ蛋白序列,用CLUSTAL X软件对其氨基酸序列进行了比对,并用邻住相接法构建了系统进化树.结果表明,尽管不同来源的PKSⅢ序列表现了很大的差异,但保守结构域CHS-like所包含的主要功能位点半胱氨酸(Cys184)、苯丙氨酸残基(Phe236和Phe286)、组氨酸残基(His335)、天冬酰氨残基(Asn369)在各植物物种中具有很好的保守性;同时发现,在植物PKSⅢ序列中多数的Cys位点均具有较好的保守性,而且蕨类植物PKSⅢ和单子叶植物PKSⅢ在Cys保守位点有很好的相似性;进一步构建分子进化树表明,PKSⅢ基因基本上首先根据功能而聚类,明显地划分为CHSs和non-CHSs两类,其次按照不同的植物物种聚类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张秀清	中国农业大学食品科学与营养工程学院	32	192	8.0	12.0
2	孙君社	中国农业大学食品科学与营养工程学院	122	1924	25.0	35.0
3	王波	中国农业大学食品科学与营养工程学院	30	308	8.0	17.0
4	翟玉盼	中国农业大学食品科学与营养工程学院	1	3	1.0	1.0
5	孙立伟	中国农业大学食品科学与营养工程学院	3	20	3.0	3.0