人工神经网络-紫外光谱法短串联重复序列基因分型检测

• 作者: 汪雪娇 牟红元 谢洪平 豆兴茹 邱婷 鲁辉
• 来源期刊: 分析化学
• 学科: 化学
• 关键词: 短串联重复序列 紫外光谱 人工神经网络 基因分型
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1701-1705
• 分类号: R346|O657.32
• 字数: 3961字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1096.2011.01701

摘要

以STR基因座D16S539中的总核心重复串数相差较小的10-11,10-12,11-11和10-13基因型为研究对象,以紫外光谱为判别变量,建立了以人工神经网络(ANN)提取富信息变量为基础的ANN基因分型方法.在优化条件下,对4个基因型样本进行了聚合酶链式反应扩增,以扩增样本在200～310 nm范围内的检测光谱进行预处理和偶合的ANN-ANN网络优化.结果表明,提取富信息变量和基因分型的ANN的最优网络结构分别为391-50-391和50-6-4,该结构下的判别模型的校正相对均方根误差(RMS)和预测RMS分别是0.0279和0.0418,模型表现出了良好的稳健性和100％的基因型正确预测率.成功实现了基于紫外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪雪娇	苏州大学医学部药学院	3	4	1.0	2.0
2	豆兴茹	苏州大学医学部药学院	11	18	3.0	4.0
3	邱婷	苏州大学医学部药学院	3	3	1.0	1.0
4	谢洪平	苏州大学医学部药学院	56	223	7.0	12.0
5	鲁辉	苏州大学医学部药学院	6	11	2.0	2.0
6	牟红元	苏州大学医学部药学院	4	22	2.0	4.0