奶牛DRB3基因生物信息学分析

• 作者: 徐飞 成述儒 罗玉柱
• 来源期刊: 中国奶牛
• 学科: 农学
• 关键词: 主要组织相容性复合体 DRB3基因 生物信息学 奶牛
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 4-8
• 分类号: S823
• 字数: 3791字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4264.2011.02.002

摘要

利用生物基因组学数据库,对奶牛MHC Ⅱ区DRB3基因进行生物信息学分析,以预测DRB3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建DRB3同源基因的系统进化树.结果表明,DRB3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29～30位的氨基酸之间.二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主,主要在细胞质中发挥生物学作用.序列分析表明,DRB3编码产物可能具有免疫应答、受体、胁迫应答、信号转导等功能,可能在免疫应答和胁迫应答过程中发挥重要作用,可能对奶牛免疫力和抗病性起关键作用.DRB3编码产物氨基酸邻接系统树表明,奶牛DRB3与绵羊、羚羊、塔尔羊、麝牛、亚洲水牛等物种DRB3氨基酸距离较近,它们具有高度同源性.