网络基序:生物网络的最小研究单位

• 作者: 刘少飞 陈长水
• 来源期刊: 科技导报
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物网络 网络基序 转录网络 基因电路
• 年，卷（期）: 2011,（28）
• 所属期刊栏目: 综述文章
• 页码范围: 74-79
• 分类号: Q612
• 字数: 6420字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3981/j.issn.1000-7857.2011.28.012

摘要

网络基序( network motif),是从生物网络中分解得到的最小研究单位,是构成生物网络的“砖块”,是系统生物学中最简单的研究对象.网络基序存在于各种生物网络中,具有信息处理的功能,通过理论和实验分析发现网络基序有重要的动力学功能.本文总结了网络基序的类型和功能研究方面的工作,包括转录网络中的基序(自我调节或者是反馈(负反馈(NAR)和正反馈(PAR)),正反馈环(FFL),单输入基序(SIM),多级输入基序(MIMs),链式调节子基序(Regulator Chain Motifs),多组分环基序(Multi-component Loop),桥基序和砖基序(Bridge and Brick motif)),信号转导网络中的基序和神经基序(神经元连接的样式),以及发掘和分析基序的数据库和工具.总结了基序的电路视角、进化以及对基序的反对意见,在应用方面,网络基序可能对合成生物学有重要的作用,最后对基序的研究工作提出了建议.网络基序可能是系统生物学的生物网络分析的初级形式,它为模块的分析和合成生物学提供了理论和实验的范本,网络基序需要用更多的网络,更多的在体实验分析,它的进一步发展可能会给生物网络理论带来重大的定则( principle)发现.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈长水	华南师范大学光子纳米生物技术研究中心	23	100	6.0	9.0
2	刘少飞	华南师范大学光子纳米生物技术研究中心	1	0	0.0	0.0