烤烟SNARE蛋白基因T-NTGP2全长cDNA克隆与生物信息学分析

• 作者: 胡重怡 蔡刘体
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 烤烟 SNARE 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 77-81
• 分类号: Q811.4
• 字数: 2856字
• 语种: 中文

摘要

从烤烟品种南江3号(Nicotiana tobacum cv.Nanjiang-3)均一化cDNA文库中克隆获得一个SNARE蛋白同源性较高的cDNA全长序列,命名为T-NTGP2,GenBank中的登录号为HO663897.利用ORF finder和ProtParam软件分析显示,它包含一个长度为597 bp的完整开放读码框,编码一个含有199个氨基酸、等电点为6.96、分子量为22.59 kD的蛋白.Blast搜索结果及进化分析结果表明,烤烟T-NTGP2基因编码的蛋白与烤烟、杨树和蓖麻的Ykt6蛋白具有较高的同源性,其一致性分别为99％、91％和91％.该基因编码的蛋白具有一个典型的VAMP基元,同源分析表明该蛋白属于SNAREs中特殊longins中的Ykt6蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡重怡		4	43	2.0	4.0
2	蔡刘体		3	9	1.0	3.0