原文服务方: 东北林业大学学报       
摘要:
利用Blastx将角毛壳茵(Chaetomium cupreum)ESTs与GenBank的Nr数据库进行相似性比对,获得1条编码木聚糖酶基因的全长cDNA序列的EST( GenBank Accn:DV547992),依据该序列设计并合成引物,以角毛壳茵基因组为模板进行PCR扩增,获得角毛壳菌xyn24的全长DNA序列,该DNA序列全长875 bp,由1个内含子和2个外显子组成;cDNA序列全长690 bp,编码229个氨基酸,蛋白质的相对分子质量为24700,理论等电点为7.83.经BlastP分析,xyn24基因的氨基酸序列的保守性不高,与嗜热革节孢菌(Scytalidium thermophilum AB114442)中的木聚糖酶基因的同源性最高,为78%,故推测该基因可能是1条新发现的木聚糖酶家族基因,该序列已收录于GenBank,登录号为:DQ886937,EF026978.
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文献信息
篇名 来源于角毛壳茵的木聚糖酶xyn24基因克隆及特性
来源期刊 东北林业大学学报 学科
关键词 角毛壳茵 木聚糖酶基因 生物信息学
年,卷(期) 2011,(9) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 105-107,120
页数 分类号 Q936
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-5382.2011.09.032
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作者信息
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1 杨谦 191 3458 29.0 49.0
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研究主题发展历程
节点文献
角毛壳茵
木聚糖酶基因
生物信息学
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
月刊
1000-5382
23-1268/S
大16开
1957-01-01
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
0
总被引数(次)
68015
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