一种对预测Motifs算法的评价策略

• 作者: 张斐
• 来源期刊: 计算机技术与发展
• 学科: 工学
• 关键词: Motifs预测 算法比较 评价策略
• 年，卷（期）: 2011,（10）
• 所属期刊栏目: 应用开发研究
• 页码范围: 171-175
• 分类号: TP181
• 字数: 4377字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-629X.2011.10.045

摘要

主要研究了如何评价蛋白质家族Motifs预测算法的预测结果,目的是在对传统的算法预测问题分析优化的基础上,制定新的评价策略.主要方法是通过对MEME算法和PKG算法预测结果的比较分析,计算同一家族中Motifs的敏感性和特异性并比较它们对应的ROC曲线,确定真实的Motifs,进而获得该蛋白质家族的最佳Motifs的模型.实验结果表明这种评价策略可用于算法对蛋白质家族Motifs预测结果的评价,还可利用确定的最佳Motifs搜索数据库来预测蛋白质家族中其他的Motifs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张斐	陕西警官职业学院信息技术系	17	23	3.0	4.0