圩猪H-FABP基因多态性分析及其与IMF含量的相关性

• 作者: 丁月云 张陈华 殷宗俊 王阳
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 圩猪 H-FABP基因 IMF含量 序列分析 PCR-RFLP
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1063-1070
• 分类号: S828
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.05.025

摘要

[目的]探究圩猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因的多态性,及其与IMF含量的相关性[方法]采用PCR-RFLP(Hinf I,HaeⅢ及MspI3种限制性内切酶)分子标记技术,分析了123头圩猪H-FABP基因5'-上游区和第二内含子区的遗传变异情况.[结果](1)在5'-上游区:Hinf I位点上存在多态性,等位基因H的基因频率为0.6545,表现为中度多态(PIC=0.3500);第二内含子区:Hinf I*位点上存在多态性,等位墓因B的基因频率为0.7195,表现为中度多态(PIL60.3222);Hae Ⅲ位点上也存在多态性,等位基因D的基因频率为0.6301,表现为中度多态(PIC＝0.3575);而Msp I位点上尚未检测到多态,基因型均为AA型.(2)被测猪群的基因频率和基因型频率都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05); (3)所检测的基因型对肌内脂肪(IMF)含量影响的趋势为:HH＞Hh＞hh,dd＞Dd＞DD,BB＞Bb＞bb;遗传效应值分别为:4.6918、4.2665、3.7712、4.6124、4.3167、3.8173、4.3042、4.2358、4.1970;(4)对H-FABP基因3个PCR-RFLP多态片段进行克隆测序分析发现,Hinf I-RFLP是由于1324 by处存在T→C的突变引起,HaeIH-RFLP是由于1811 by处存在C→G的突变引起,Hinf I*-RFLP是由于1970 by处存在C→T的突变引起.测序结果与GenBank公布的X98558和Y16180序列有97.9%及98.3%的同源性.[结论]圩猪H-FABP基因5'-游区和第二内含子区的多态性对其IMF含量有一定影响,但是否可作为研究该基因与圩猪IMF含量相关的重要遗传标记还需做进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	殷宗俊	安徽农业大学动物科技学院	107	617	14.0	18.0
2	王阳	安徽农业大学动物科技学院	7	53	4.0	7.0
3	丁月云	安徽农业大学动物科技学院	28	176	8.0	12.0
4	张陈华	安徽农业大学动物科技学院	14	147	7.0	12.0