双壳纲贝类18S rRNA基因序列变异及系统发生

• 作者: 孟学平 申欣 程汉良 赵娜娜
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 双壳纲 18S rRNA 基因 序列分析 系统发生
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 页码范围: 1393-1403
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文

摘要

双壳纲贝类栖息于环境多变的海域,是一个形态学和生态学都具有多样性的类群,清晰而可靠的进化关系对于养殖与相关种类的管理具重要意义.然而,目前对双壳类宏观分子系统学研究的报道较少.研究用18S rRNA基因(18S)分析了双壳类3个亚纲贝类的系统发育关系.从GenBank下载帘蛤目、海螂目、贻贝目、胡桃蛤目、蚶目、珍珠贝目6个目94个种类的18S全/部分序列107个,通过ClustalX软件进行序列比对,用MEGA4.1软件和PHyML软件计算遗传距离,构建系统发育树,研究了双壳类18S变异规律及其在系统发生研究中的应用.结果显示18S有插入/缺失序列,存在长度多态性.序列比对显示有5段约30 70bp的保守区,4段约130 550bp的高变区.碱基组成平均为T:24.4%,C:23.6%,A:24.5%,G:27.5%.G+C含量为51.1%.在1796个比对位点中,变异位点占31.7%,简约信息位点占24.0%.目内科间遗传距离为0.003 0.043,目间遗传距离为0.026 0.093.NJ树和ML树显示贻贝目、珍珠贝目、胡桃蛤目、蚶目和海螂目的缝栖蛤科先分别聚为支持率很高(BPN=94 100)的单系支,后聚为一大支(BPN=100).蛤蜊科与帘蛤目的其他科分离形成一置信度很高的单系支(BPN=93).帘蛤科种类聚为置信度较低(BPN=60)的一支.海螂目、帘蛤目的种类没能完全聚到所属支系,彼此嵌套,缝栖蛤科的种类从海螂目中分离出来.18S资料揭示帘蛤目的蛤蜊科、海螂目的缝栖蛤科已经进化为独立的支系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院	37	175	8.0	11.0
2	孟学平	淮海工学院海洋学院	46	339	11.0	15.0
3	程汉良	淮海工学院海洋学院	62	727	14.0	24.0
4	赵娜娜	淮海工学院海洋学院	1	11	1.0	1.0