嗜热链球菌谷氨酸脱羧酶基因及其侧翼区序列分析

• 作者: 别小妹 吕凤霞 杨胜远 林谦 邹晓葵 陆兆新
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 嗜热链球菌 谷氨酸脱羧酶 γ-氨基丁酸 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 121-125
• 分类号: Q78
• 字数: 2852字
• 语种: 中文

摘要

从嗜热链球菌Streptococcus thermophilus Y-2的谷氨酸脱羧酶基因(gadB)及其两侧旁邻序列出发,在GenBank中分别用Blastn、Blastx搜索同源序列.gadB在核酸水甲上无法找到同源序列,在蛋白质水平上与多种细菌的谷氨酸脱羧酶同源.根据谷氨酸脱羧酶的氨基酸序列构建系统发育树,菌株Y-2与具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum subsp.polymorphum ATCC 10953的亲缘关系最近.gadB的上游侧翼区与嗜热链球菌LMG 18311的插入序列IS1216转座酶基因具有很高的相似性.gadB的下游侧翼区在核酸水平上未找到同源序列,在蛋白质水平上与谷氨酸/γ-氨基丁酸转运蛋白有很高的相似性.菌株Y-2的gadB、gadC排列方式与大肠杆菌、弗氏志贺菌的相同,而与乳酸乳球菌、短小乳杆菌的相反.在已完成全基因组测序的3个模式株Streptococcus thermophilus LMG 18311、CNRZ1066、LMD-9中均含有插入序列IS1216,但未发现谷氨酸脱羧酶基因gadB、谷氨酸/γ-氨基丁酸转运蛋白基因gadC.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	别小妹	南京农业大学食品科技学院	134	1767	21.0	36.0
2	陆兆新	南京农业大学食品科技学院	253	4353	33.0	53.0
3	吕凤霞	南京农业大学食品科技学院	145	1968	21.0	38.0
4	杨胜远	韩山师范学院生物系	31	165	7.0	10.0
5	邹晓葵	南京农业大学食品科技学院	14	177	8.0	13.0
6	林谦	玉林师范学院化学生物系	25	77	4.0	8.0