绵羊痘病毒RP030基因的克隆及序列分析

• 作者: 吴国华 孙晓林 张强 朱海霞 李健 赵志荀 颜新敏
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 医学
• 关键词: 绵羊痘病毒 RPO30基因 序列分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 畜牧—研究报告
• 页码范围: 304-308
• 分类号: R852.659.1
• 字数: 2818字
• 语种: 中文

摘要

选择羊痘病毒RNA聚合酶RPO30进行分析,为进行RNAi羊痘病毒研究,进行目的基因的初步筛选.PCR扩增RPO30基因,连入pMD18-T simple载体并转化DH5a大肠杆菌.经蓝白斑筛选挑选白斑制备质粒,经双酶切、PCR及测序鉴定.结果成功克隆了RPO30基因,克隆的SSPV RPO30基因ORF 为585 bp,编码193个氨基酸,阅读框内有一个HindⅢ酶切位点,测序结果与GenBank数据库中不同痘病毒毒株之间同源性存在着明显区别.进一步经过生物学软件分析表明RPO30蛋白质氨基酸4-12、18-26、50-161、68-92,176-190位之间区域形成活性中心的可能性较大,选择这些区域进行作用可能会造成该基因产物酶的失活,从而高效抑制病毒的复制.