长沙市2010年手足口病EV71型VP1区基因序列分析

• 作者: 叶文 孙边成 宋克云 张如胜 欧新华 陈法明
• 来源期刊: 实用预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 VP1 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 420-424
• 分类号: R373
• 字数: 4167字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-3110.2011.03.013

摘要

目的 了解2010年长沙市手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重症和普通病例肠道病毒71型(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1区基因特征.方法 收集12例HFMD重症和普通病例的咽拭子或肛拭子标本进行VP1区基因RT-PCR扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用sequin软件提交至GenBank,Lasergene和Mega5软件对测序结果进行氨基酸比对分析和构建进化树.结果 12株EV71 VP1区基因序列在进化树上与C基因型中的C4<'a>亚型代表株属同一分支,在核苷酸同源性分析中,12株EV71与C4<'a>亚型代表株(3254-TAI-98)的同源性达到92.6%～93.3%,高于与A、B、C1、C2、C3、CVA16型或亚型代表株的同源性(分别为79.9%～80.7%、83.1%～84.0%、87.9%～88.7%、89.1%～89.8%、87.8%～88.2%和57.3%～58.4%);12株EV71病毒VP1之间的核苷酸有高度的同源性:同源性为98.1%～100.0%,高于与C4亚型代表株的同源性(92.6%～93.3%和91.8%～92.7%).2010年分离自长沙的重症和普通病例与2008年分离自北京、深圳和阜阳的EV71病毒VP1基因序列之间的氨基酸变异位点少.结论 2010年长沙市流行的EV71型病毒属于C基因型中的C4亚型;12例HFMD重症和普通病例的EV71 VP1区基因序列差异较小;不同时间、不同地区和不同病例来源的EV71 VP1区氨基酸变异位点无关联.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋克云		7	60	4.0	7.0
2	张如胜		11	52	5.0	7.0
3	欧新华		14	58	5.0	7.0
4	孙边成		7	24	4.0	4.0
5	陈法明		6	26	3.0	5.0
6	叶文		7	35	4.0	5.0