KNN法在含纤连蛋白域蛋白质亚细胞定位中的应用

• 作者: 周跃 张瑗 李立奇 王开发
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: K最近邻法 纤连蛋白 亚细胞定位 氨基酸组成
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 20-21
• 分类号: R604
• 字数: 1777字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2011.02.012

摘要

目的 探讨K最近邻(KNN)法在含纤连蛋白(FN)域蛋白质亚细胞定位中的应用价值.方法 选取含FN域蛋白质80个(40个细胞外蛋白质和40个细胞内蛋白质),采用KNN法进行蛋白质亚细胞定位,并采用jackknife检验法和5维交叉验证法检验样本的定位的准确率.结果 KNN法定位细胞内蛋白36个,细胞外蛋白35个.jackknife法检验KNN法蛋白质定位准确率为88.75%, 5维交叉法验证其定位准确率为82.5%.结论 利用KNN法可较准确的预测含FN域蛋白质的亚细胞位置.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周跃		354	4854	36.0	56.0
2	王开发	第三军医大学计算机教研室	42	437	10.0	20.0
3	李立奇		13	78	4.0	8.0
4	张瑗		14	73	4.0	8.0