目的:对2010年上海市手足口病哨点医院一复旦大学附属儿科医院送检的疑似重症手足口病病例样本进行实验室检测分析,从而为本地区手足口病的综合防治提供参考资料.方法:收集2010年哨点医院一复旦大学附属儿科医院疑似重症手足口病病例送检的咽拭、粪便、肛拭样本,应用real time RT-PCR技术检测肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16 型(CVA16)、肠道病毒通用型(EV).结果:832份不同类型的样本中,粪便样本的检测阳性率最高,咽拭最低,两者阳性检出率有显著性差异(P<0.01).431例疑似重症手足口病病例中,EV71病毒、CVA16病毒、非EV71和非CVA16的EV病毒阳性率分别为:81.90%、5.10%、6.03%;病例人群男性高于女性(1.80:1),1岁~4岁年龄段病例数最多,5月-7月为高发月份.结论:EV71型是2010年本地区手足口病流行的主要致病病毒类型,其流行具有明显的年龄、季节界限.