基于不确定PPI网络的功能模块挖掘

• 作者: 孟雅 尚学群 王淼 缪苗
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 功能模块 蛋白质交互 不确定图 期望稠密度 相关度
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 4481-4484,4491
• 分类号: TP311
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.12.021

摘要

近年来,挖掘具有生物学意义的功能模块,吸引了很多人的关注.但是,生物信息学中的蛋白质交互(PPI)网络和其他的一些生物数据常常会由于实验检测方法的局限性而呈现出不确定性.以具有不确定性的PPI数据为研究对象,挖掘蛋白质复合物.引入了一些新概念,并给出了一个深度优先算法.使用MIPS数据库评估实验结果表明,该算法在精确度和覆盖率两个方面性能优良.在基因拓扑上分析实验结果证实了所得到的大多数蛋白质复合物具有很高的相似性.最后也对算法的可扩展性进行了验证.总之,可以有效地从不确定PPI网络中挖掘出功能模块.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚学群	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	23	67	5.0	5.0
2	王淼	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	24	160	6.0	11.0
3	孟雅	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	4	5	2.0	2.0
4	缪苗	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	3	11	2.0	3.0