阴沟肠杆菌的Hy3AL和hycA部分基因克隆及序列分析

• 作者: 任南琪 李伟光 林海龙
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 地球科学
• 关键词: CODEHOP 甲酸氢酶抑制因子 氢化酶3大亚基 阴沟肠杆菌NRRL B-414
• 年，卷（期）: 2011,（15）
• 所属期刊栏目: 生物技术-研究报告
• 页码范围: 233-238
• 分类号: X172
• 字数: 3620字
• 语种: 中文

摘要

为了克隆氢化酶3大亚基(HyA3L)和甲酸氢酶抑制因子(hycA),研究其在阴沟肠杆菌产氢代谢中的作用和机制,笔者利用CODEHOP设计阴沟肠杆菌NRRLB-414的HyA3L和hycA简并引物,选用引物HyA3J和HycAJ扩增基因组DNA,分别得到约1500、150bp的PCR产物,该产物连接pMD18-T载体,并克隆转化至E.coli DH5α感受态细胞中,经筛选后测序.推导的HyA3J扩增产物氨基酸序列与Enterobacter cancerogenus ATCC 35316的HyA3L蛋白一致性最高达到99%,仅有3个氨基酸的差异,表明其为阴沟肠杆菌的HyA3L;推导的HycAJ扩增产物氨基酸序列与Enterobacter cloacae subsp.cloacae ATCC 13047的HycA蛋白一致性最高达到92%,仅有4个氨基酸的差异,表明其为阴沟肠杆菌的hycA.通过以上分析可得出,采用CODEHOP程序设计的简并引物可信性强,阳性率高.阴沟肠杆菌NRRL B-414的氢化酶3大亚基和甲酸氢酶抑制因子部分基因的成功克隆,为获得氢化酶3大亚基和甲酸氢酶抑制因子的基因全长克隆奠定基础,不但可以增加这2个基因的资源,也可为其基因敲除等代谢工程研究提供科学依据和工作基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任南琪	哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室	354	8755	48.0	76.0
2	李伟光	哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室	123	1544	23.0	33.0
3	林海龙	哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室	12	95	6.0	9.0