隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptum JF-5分泌蛋白质组的分析

• 作者: 夏金兰 张奉波 张成桂 焦春香
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 地球科学
• 关键词: 隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptumJF-5 分泌蛋白质组 信号肽
• 年，卷（期）: 2011,（28）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 17168-17171,17175
• 分类号: X703.1
• 字数: 4412字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2011.28.019

摘要

[目的]对隐藏嗜酸菌(Acdiphiliumc cryptum JF-5)全基因组的3 063个氨基酸序列进行预测,分析其分泌蛋白质组的构成.[方法]利用信号肽预测软件SignalP v3.0、跨膜螺旋结构预测软件TMHMM v2.0 、RR-motif信号肽预测软件TatP v1.0、脂蛋白质信号肽预测软件LipoP v1.0、非经典分泌蛋白质预测软件SecretomeP和亚细胞定位软件Psortb v2.0.4对Acidiphilium cryptum JF-5全基因组的3 063个氨基酸序列进行预测分析.[结果]在隐藏嗜酸菌Acidiphilium cryptum JF-5中有444个蛋白质为分泌蛋白质,其中分泌型信号肽148个,RR-motif亚组型信号肽27个,脂蛋白质信号肽22个,无Prepiplin-like信号肽,非经典分泌蛋白质247个；另外,对分泌型信号肽的长度分布、氨基酸使用频率和酶切位点的氨基酸使用频率作出了统计分析.[结论]研究结果为进一步研究嗜酸菌Acidiphiliumc cryptumJF-5的基因功能提供了丰富的信息基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张成桂		15	156	8.0	12.0
3	夏金兰	中南大学资源加工与生物工程学院	51	997	14.0	31.0
6	焦春香		9	61	5.0	7.0
7	张奉波	中南大学资源加工与生物工程学院	1	1	1.0	1.0