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昆虫共生菌沃尔巴克氏体(Wolbachia)的wsp基因密码子使用模式分析
昆虫共生菌沃尔巴克氏体(Wolbachia)的wsp基因密码子使用模式分析
作者:
刘彦群
姜义仁
李苗苗
石生林
秦利
谌苗苗
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
昆虫共生细菌
沃尔巴克氏体
外膜蛋白基因
碱基组成
密码子使用模式
摘要:
沃尔巴克氏体(Wolbachia)主要感染昆虫等节肢动物,是一类革兰阴性共生细菌.为探讨昆虫纲共生菌Wolbachia的系统发育,研究Wolbachia基因组中进化速度较快的外膜蛋白基因wsp的密码子使用模式及影响因素,统计分析该基因的GC含量(GCall、GC1、GC2、GC3、GC3s)、有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)等指标.结果显示:昆虫纲共生菌Wolbachia的wsp基因密码子偏好性均不强,昆虫纲不同目间共生菌Wolbachia的wsp基因碱基组成及ENc值差异较小;多数基因数据点沿标准曲线或在其附近分布,突变对碱基组成的影响较弱;18种由多个密码子编码的氨基酸中有11种氨基酸的偏好性密码子在昆虫纲7个目及对照蛛形纲1个目间均相同,有2种氨基酸的偏好性密码子在7个目间相同,这些密码子均以A/U结尾;供分析的140个wsp基因中仅编码6个半胱氨酸(Cys);对应分析中第1、第2向量轴贡献率均不高,分别为13.53%和12.49%,均与碱基组成(GC1、GC2、GC3)显著相关.综合各项分析认为,Wolbachia的wsp基因密码子偏好性不具有宿主分类特异性,密码子使用模式主要受碱基组成影响,而碱基组成主要受选择影响.
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内容分析
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文献信息
篇名
昆虫共生菌沃尔巴克氏体(Wolbachia)的wsp基因密码子使用模式分析
来源期刊
蚕业科学
学科
生物学
关键词
昆虫共生细菌
沃尔巴克氏体
外膜蛋白基因
碱基组成
密码子使用模式
年,卷(期)
2012,(1)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
109-115
页数
分类号
Q939.1
字数
4789字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.0257-4799.2012.01.019
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
石生林
沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省昆虫资源工程技术研究中心
57
230
10.0
12.0
2
刘彦群
沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省昆虫资源工程技术研究中心
45
305
11.0
15.0
3
秦利
沈阳农业大学生物科学技术学院
109
526
13.0
17.0
4
姜义仁
沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省昆虫资源工程技术研究中心
58
202
9.0
12.0
5
李苗苗
沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省昆虫资源工程技术研究中心
2
8
1.0
2.0
6
谌苗苗
沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省昆虫资源工程技术研究中心
1
1
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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参考文献
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节点文献
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沃尔巴克氏体
外膜蛋白基因
碱基组成
密码子使用模式
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
蚕业科学
主办单位:
中国蚕学会
中国农业科学院蚕业研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
0257-4799
CN:
32-1115/S
开本:
大16开
出版地:
江苏省镇江市中国农业科学院蚕业研究所
邮发代号:
28-23
创刊时间:
1963
语种:
chi
出版文献量(篇)
2881
总下载数(次)
12
总被引数(次)
23392
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