广西猪源H9N2亚型流感病毒全基因组序列分析

• 作者: 付薇 伍和明 何奇松 孙翔翔 徐贤坤 易春华 熊毅 蒋家霞 韦达有
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 猪源流感病毒 H9N2亚型 全基因组 序列分析 广西
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·桑蚕
• 页码范围: 389-392
• 分类号: S852.659.5|S858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2012.03.389

摘要

[目的]了解广西猪源H9N2亚型流感病毒的来源及变异情况,为有效防控广西猪源H9N2亚型流感病毒奠定基础.[方法]运用RT-PCR对广西分离株A/SW/GX/S11/05( H9N2)进行全基因组扩增,并克隆测序及对比分析.[结果]扩增获得的HA、NA、NP、M、NS、PB1、PB2和PA基因片段长度分别为1683、1401、1497、1027、890、2233、2280和2151 bp,其推导氨基酸分别为561、467、499、349、338、744、760和717 aa.经过序列分析,发现各基因片段的核苷酸及其推导氨基酸与A/Bird/GX/62/05株的同源性最高,分别为96.2％～ 100.0％和98.5％～99.6％；系统进化分析也表明A/SW/GX/S11/05株与A/Bird/GX/62/05株的亲缘关系最近.[结论]广西猪源H9N2亚型流感病毒属于欧亚谱系的北京亚系,且在一定时间内不同宿主间均有感染,在今后的流感病毒防治工作中,跨种属传播是一个不可忽视的问题.