草鱼(AG)微卫星标记克隆及特征分析

• 作者: 廖兰杰 朱作言 杜富宽 江遥 汪亚平 石米娟 连灏 黄容
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 微卫星 三链捕获 多态信息含量(PIC)
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 29-34
• 分类号: Q789
• 字数: 5019字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2012.00029

摘要

报道了一种简便高效克隆微卫星序列的方法.这一方法的实施步骤包括小片段基因组文库构建、三螺旋捕获、磁珠分离和PCR扫描.草鱼AG重复文库的冗余率为7.2％,富集效率为60.25倍,PCR扫描的准确率达100％,采用这一方法克隆到的AG重复序列中完美型、非完美型和混合型的比例分别为66.87％、17.17％和15.96％,不间断重复序列长度大于30 bp的微卫星座位占51％.34个微卫星座位中有25个表现出多态性,PIC值0.50-0.91,进一步分析表明AG重复序列的多态信息含量(PIC)与不间断重复序列长度相关,不间断重复序列长度大于30 bp的座位表现出丰富的多态性.较高的富集率和有效引物获得率证明此方法在分离草鱼微卫星中的成功应用,并将为草鱼养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等打下基础.