克隆文库分析红树林土壤中放线菌的多样性

• 作者: 屈直 洪葵 谢晴宜 马海霞
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 红树林土壤 克隆文库 放线菌 多样性
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用
• 页码范围: 1466-1470
• 分类号: Q939.13
• 字数: 2888字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2012.08.026

摘要

直接提取8个红树林土壤的总DNA,用放线菌门的特异性PCR引物进行扩增,通过构建16S rRNA文库,测序及系统发育分析,获取新颖放线菌菌株.结果发现,有酸微菌亚纲(Acidimicrobidae) (30.2％)、放线菌亚纲(Actinobacteridae) (68.0％)、红蝽菌亚纲(Coriobacteridae)(1.1％)和去腈基菌亚纲(Nitriliruptoridae)( 0.7％)成员,没有红色杆菌亚纲( Rubrobacteridae)成员.仙农指数和Chao1物种多样性指数(Schao1)表明,红树林土壤样品中含有丰富的放线菌多样性.以16S rDNA基因的相似率≥97％作为临界点,45.1％可能代表新候选种(candidate species)(未培养、分离).本研究为进一步获取新颖的红树林放线菌资源提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	洪葵	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	49	1054	16.0	31.0
2	屈直	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	19	50	5.0	6.0
3	马海霞	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	21	73	5.0	7.0
4	谢晴宜	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	7	26	3.0	5.0