大口黑鲈微卫星DNA指纹图谱的构建和遗传结构分析

• 作者: 任坤 叶星 李胜杰 樊佳佳 白俊杰
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大口黑鲈 微卫星标记 指纹图谱 遗传距离
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 600-609
• 分类号: S965.199
• 字数: 3963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2012.00600

摘要

以国内目前养殖的大口黑鲈[ Micropterus salmoides (Lacépède)]群体(CH)、2009年引进的佛罗里达亚种(FL-09)、2010年引进的佛罗里达亚种(FL-10)、2010年引进的北方亚种(NT-10)为实验材料,应用43个微卫星DNA标记对这4个大口黑鲈群体进行遗传检测,构建了各群体的微卫星DNA指纹图谱,并对其遗传结构进行分析.结果显示:CH、FL-09、FL-10和NT-10群体的平均等位基因数(A)分别为2.58、3.74、3.70和4.21,平均期望杂合度(He)分别为0.4549、0.4896、0.5010和0.6138,平均多态信息量(PIC)分别为0.3786、0.4443、0.4566和0.5546,表明国内目前养殖的大口黑鲈群体遗传多样性水平远远低于国外新引进的大口黑鲈群体.利用UPGMA法对4个群体进行聚类,结果FL-09和FL-10聚为一支,遗传距离为0.0506; NT-10和CH聚为另一支,遗传距离为0.4244,推测FL-09和FL-10两个佛罗里达亚种属于相同的群体,而NT-10和CH两个北方亚种来自不同的群体,甚至不同的水系.同时从指纹图谱中,筛选到5个特异的微卫星标记(JZL114、MiSaTPW11、Lma120、Mdo6和Msa121),可以鉴别FL、NT-10和CH群体,其中MiSaTPW11和Msa121这两个标记组合可以完全鉴别这3个群体.将5个特异性微卫星标记的图谱数据转化成计算机可以识别的数码指纹,可以方便应用于大口黑鲈不同群体及其杂交种的鉴定.研究结果可以为我国大口黑鲈种质资源保存、品种鉴定和良种选育提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白俊杰	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	104	1312	20.0	28.0
2	樊佳佳	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	15	75	5.0	8.0
3	李胜杰	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	36	249	10.0	14.0
4	任坤	中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室	1	17	1.0	1.0