商城肥鲵二碱基重复和四碱基重复微卫星DNA的结构特征及对筛选效率的影响

• 作者: 史文博 周立志 常青 张保卫 王慧 韩德民 骆侠
• 来源期刊: 生物多样性
• 学科: 生物学
• 关键词: 微卫星结构 微卫星DNA家族 Pachyhynobius shangchengensis 筛选效率
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 51-58
• 分类号: Q75
• 语种: 中文

摘要

两栖类有尾目物种的微卫星分离中的筛选成功率常常较低.为探索微卫星结构对筛选效率的影响,本研究通过AFLP快速分离法(fast isolation by AFLP of sequences containing repeats,FIASCO)对商城肥鲵(Pachyhynobiusshangchengensis)二碱基重复类型和四碱基重复类型微卫星进行分离,并对微卫星序列进行了分析.研究中发现二碱基微卫星位点多以微卫星DNA家族形式存在,并因此导致了微卫星位点分离较低的筛选率;在四碱基重复的微卫星位点中未发现微卫星DNA家族的存在.对研究中得到的3个微卫星DNA家族的分析发现,同一家族的上、下游侧翼序列变异程度存在差异;毗邻微卫星重复单元区的侧翼序列碱基变异程度较高,而较远处的区段则相对保守.这些结构特征可能反映出微卫星DNA家族在演化中的复杂性.本文的研究结果提示在两栖动物的一些类群中,微卫星的筛选必须考虑微卫星DNA家族的影响,选取适宜的碱基重复类型将是决定筛选效率的关键.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常青	南京师范大学生命科学学院	38	611	12.0	24.0
2	周立志	安徽大学生命科学学院	76	805	18.0	25.0
3	韩德民	安徽大学生命科学学院	19	120	7.0	9.0
4	张保卫	安徽大学生命科学学院	29	183	8.0	12.0
5	王慧	安徽大学生命科学学院	22	136	5.0	11.0
6	史文博	安徽大学生命科学学院	2	20	2.0	2.0
7	骆侠	安徽大学生命科学学院	3	12	2.0	3.0