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摘要:
目的 了解广东省和广西地区AIDS患者马尔尼菲青霉菌(PM)分离株rDNA转录间隔区(ITS)序列的特征和变异.方法 AIDS患者PM分离株15株,其中12株来源于广东,3株来源于广西.运用真菌核糖体通用引物ITS1和ITS4,对其rDNA ITS进行扩增和测序,测序结果在GenBank核酸序列数据库中进行同源序列搜索,构建NJ系统树.结果 15株PM分离株rDNAITS序列长度为578 bp,包括18S rRNA、ITS1、5.8S rRNA、ITS2及28S rRNA,与来源于日本和泰国的PM的rDNA ITS序列一致性高达97%~100%,同源性100%;11株广东来源PM和1株广西来源PM菌株rDNA ITS序列完全相同,1株广东来源PM和2株广西来源PM菌株的rDNA ITS序列存在1个碱基差异;分子进化树显示,PM与毛霉菌、稻根霉菌rDNA ITS序列的遗传距离最远,与支顶孢菌、组织胞浆菌及青霉属其他菌种如嗜松青霉、棘孢青霉的rDNA ITS序列的种间遗传距离较小.结论 广东和广西地区AIDS患者PM分离株的rDNA ITS序列非常保守,可作为靶基因来设计PM的种特异性引物,用于菌种鉴定.
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文献信息
篇名 艾滋病患者马尔尼菲青霉菌rDNA转录间隔区序列分析
来源期刊 中华传染病杂志 学科
关键词 马尔尼菲青霉菌 DNA,核糖体 序列分析 获得性免疫缺陷综合征
年,卷(期) 2012,(11) 所属期刊栏目 基础论著
研究方向 页码范围 647-651
页数 5页 分类号
字数 3229字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2012.11.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 唐小平 广州市第八人民医院感染科 193 1461 18.0 29.0
2 陈万山 广州市第八人民医院感染科 43 507 12.0 21.0
3 蔡卫平 广州市第八人民医院感染科 124 1208 17.0 29.0
4 李凌华 广州市第八人民医院感染科 62 368 10.0 16.0
5 邝燕玲 广州市第八人民医院感染科 7 45 4.0 6.0
6 胡凤玉 广州市第八人民医院感染科 38 151 7.0 10.0
7 宋伟南 广州市第八人民医院感染科 9 49 5.0 7.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
马尔尼菲青霉菌
DNA,核糖体
序列分析
获得性免疫缺陷综合征
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华传染病杂志
月刊
1000-6680
31-1365/R
16开
上海市北京西路1623号
4-352
1983
chi
出版文献量(篇)
5047
总下载数(次)
12
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