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摘要:
本研究克隆了仿刺参(Apostichopus japonicus)P450c17基因的全长cDNA,结果表明其cDNA的5′端UTR为256 bp,3′端UTR为250 bp,ORF为l 530 bp.在3′端有特殊序列ATTTA、终止密码子TAA和polyA加尾.其全长cDNA编码509个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子量57.6 kD,理论等电点5.5.P450c17的氨基酸序列存在长度为25个氨基酸的信号肽,1个长度为22个氨基酸的跨膜区,1个糖基结合位点NHS,1个P450特有的结构域,其氨基酸序列具有明显的细胞色素P450基因家族的特征.结构域中亚铁血红素结合域中的精氨酸R和发挥活性所必须的半胱氨酸C都是保守的.这些结构组成了血红素结合环、质子传递槽和K螺旋及绝对保守EXXR基序.蛋白前体二级结构中无规则卷曲占41.22%,延伸链占12.77%,α-螺旋占46.01%,不含B-折叠.氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性在35%~41%之间.系统进化树表明仿刺参与长牡蛎(Crassostrea gigas)及文昌鱼(Branchiostoma belcheri)聚为一支,黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、鲇(Clarias gariepinus)、日本鳗鲡(Anguilla japonica)及白斑角鲨(Squalus acanthias)聚为一支,三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)、金眼门齿鲷(Stenotomus chrysops)、斑马鱼(Danio rerio)、鲤(Cyprinus carpio)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、牙鲆及青鳉(Fundulus heteroclitus) 聚为一支.研究结果为进一步探讨仿刺参P450c17在性激素调控性别分化方面的功能提供参考.
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文献信息
篇名 仿刺参性别相关基因P450c17的克隆与序列分析
来源期刊 中国水产科学 学科 农学
关键词 仿刺参 P450cl 7 基因克隆 序列分析
年,卷(期) 2012,(1) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 22-32
页数 分类号 S917
字数 6700字 语种 中文
DOI 10.3724/SP.J.1118.2012.00022
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 常亚青 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 142 766 15.0 19.0
2 田燚 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 17 69 5.0 7.0
3 张丙龙 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室 2 6 2.0 2.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
仿刺参
P450cl 7
基因克隆
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国水产科学
月刊
1005-8737
11-3446/S
大16开
北京市永定路南青塔村150号
18-250
1994
chi
出版文献量(篇)
3187
总下载数(次)
1
总被引数(次)
54530
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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