蛋白质-蛋白质分子对接方法中分子柔性处理与近天然结构筛选的研究

• 作者: 常珊 曹立彬 李春华 杨峰 王存新 陈慰祖 龚新奇
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质-蛋白质分子对接 分子柔性处理 结合位点信息 结构聚类 打分函数
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 主编特约·综述
• 页码范围: 15-22
• 页数: 8页
• 分类号: Q617
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2012.10065

摘要

蛋白质-蛋白质分子对接方法是研究蛋白质分子间相互作用与识别的重要理论方法.该方法主要涉及复合物结合模式的构象搜索和近天然结构的筛选两个问题.在构象搜索中,分子柔性的处理是重点也是难点,围绕这一问题,近年来提出了许多新的方法.针对近天然结构的筛选问题,目前主要采用三种解决策略:结合位点信息的利用、相似结构的聚类和打分函数对结构的评价.本文围绕以上问题,就国内外研究进展和本研究小组的工作作详细的综述,并对进一步的研究方向进行了展望.