贵州黑山羊独立生长因子1B基因cDNA克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘若余 张依裕 石照应 罗卫星 蔡惠芬 谈为忠 陈志
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 贵州黑山羊 GFI1B 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 27-32
• 分类号: S813.2
• 字数: 3921字
• 语种: 中文

摘要

选择与羊同源性较高的牛独立生长因子1B (GFI1B)基因序列设计特异性引物,提取贵州黑山羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对GFI1B基因进行克隆测序及序列分析.结果表明:首次克隆了贵州黑山羊GFI1B基因cDNA序列996 bp,GenBank登录号为JN662390,编码331个氨基酸.贵州黑山羊GFI1B基因与牛的同源性高达97.0％.聚类分析显示:哺乳动物、禽类和两栖类各为一类.生物信息学分析表明:山羊GFI1B分子包括1个低组分复杂性区域、6个锌指结构域ZnF-C4.同时,预测结果还表明GFI1B分子不包含信号肽序列且没有跨膜螺旋结构域,26个磷酸化位点,蛋白糖基化位点有7个.