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应用MALDI-TOF-MS检测原发性肝癌骨转移患者血清的多肽差异谱
应用MALDI-TOF-MS检测原发性肝癌骨转移患者血清的多肽差异谱
作者:
何健
曾昭冲
杜世锁
杨平
陈兵
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝肿瘤
血清
肽类
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱
肿瘤分子标志物
摘要:
目的:应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统分析原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)骨转移患者血清多肽差异谱,寻找具有潜在诊断意义的血清分子标志物.方法:收集50例HCC骨转移患者和50例HCC未骨转移患者的血清,分成训练组(76例)和验证组(24例).所有样本分别经ClinProt磁珠纯化、MALDI-TOF-MS检测及ClinProTools软件进行血清多肽差异谱分析.应用液相色谱质谱联用的方法对差异多肽进行序列鉴定.应用径向基神经网络(radial basis function neural network,RBFNN)算法建立诊断模型,并对诊断模型进行单盲法实验验证.结果:HCC骨转移患者中,共获得10条差异有统计学意义[P (Wilcoxon-test)<0.001]的多肽峰,并成功鉴定了其中7条肽段(质荷比分别为1 780.7、1 866.5、2 131.6、2 880.4、1 532.4、2 489.8和2 234.3)的氨基酸序列,这些肽段的来源蛋白分别为甲胎蛋白(alpha-fetoprotein)、凝血酶原(prothrombin)、丝甘蛋白聚糖(serglycin)、交联-α-胰蛋白酶抑制物H4重链异构体2(isoform 2 of inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4)、自噬相关蛋白16-2异构体1(isoform 1 of autophagy-related protein 16-2)、转甲状腺素蛋白(transthyretin)和纤维蛋白β链(fibrinogen beta chain).选取2组间统计学差异最显著的6条多肽峰(质荷比分别为1 535.4、1 780.7、1 866.5、2 131.6、2 880.4和2 901.9)建立的诊断模型的识别率为89.47%,预测率为82.89%;单盲法验证模型的灵敏度为83%,特异度为92%.结论:筛选获得的差异血清多肽可能成为潜在的诊断HCC骨转移的分子标志物.
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文献信息
篇名
应用MALDI-TOF-MS检测原发性肝癌骨转移患者血清的多肽差异谱
来源期刊
肿瘤
学科
医学
关键词
肝肿瘤
血清
肽类
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱
肿瘤分子标志物
年,卷(期)
2012,(8)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
643-649
页数
分类号
R735.7
字数
5381字
语种
中文
DOI
10.3781/j.issn.1000-7431.2012.08.014
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
曾昭冲
复旦大学附属中山医院放疗科
110
861
15.0
22.0
2
何健
复旦大学附属中山医院放疗科
25
129
7.0
10.0
3
杨平
复旦大学附属中山医院放疗科
28
146
7.0
10.0
4
陈兵
复旦大学附属中山医院放疗科
61
210
7.0
10.0
5
杜世锁
复旦大学附属中山医院放疗科
8
43
3.0
6.0
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研究主题发展历程
节点文献
肝肿瘤
血清
肽类
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱
肿瘤分子标志物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
肿瘤
主办单位:
上海市肿瘤研究所
上海交通大学医学院附属仁济医院
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-7431
CN:
31-1372/R
开本:
大16开
出版地:
上海市斜土路2200弄25号
邮发代号:
4-289
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
4424
总下载数(次)
6
总被引数(次)
33137
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