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基于茶树SNP的dCAPS标记体系研究
基于茶树SNP的dCAPS标记体系研究
作者:
刘本英
包云秀
张成才
成浩
汪云刚
王丽鸳
韦康
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
茶树
EST
SNP
dCAPS
摘要:
从茶树EST序列中搜寻出候选SNPs位点,在候选SNPs两侧设计测序引物进行PCR扩增,并对扩增产物双向测序验证;然后从每个扩增子中选择一个确证的SNPs,设计dCAPS引物,并进行扩增和酶切验证,将SNPs转化为dCAPS标记;最后,在长叶白毫×福鼎大白的F1群体中检测了标记的分离情况.结果发现,20对测序引物中有11对扩增成功,共确证了17个SNPs,占检测总数的54.8%;在设计的11对dCAPS引物中,有8对在长叶白毫、福鼎大白和龙井43等8个品种中表现出多态性,成功转化为dCAPS标记,转化成功率72.7%;8个dCAPS标记中的DCC229和DCC371在长叶白毫和福鼎大白之间表现有多态性,经检测,它们在这2个品种的F1群体中均符合孟德尔1∶1分离.
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期刊文献
内容分析
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相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
基于茶树SNP的dCAPS标记体系研究
来源期刊
茶叶科学
学科
农学
关键词
茶树
EST
SNP
dCAPS
年,卷(期)
2012,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
517-522
页数
6页
分类号
S571.1|Q52
字数
3234字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
成浩
中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心
59
991
19.0
29.0
2
王丽鸳
中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心
36
354
11.0
18.0
3
张成才
中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心
6
63
5.0
6.0
4
韦康
中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心
22
144
7.0
11.0
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节点文献
茶树
EST
SNP
dCAPS
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
茶叶科学
主办单位:
中国茶叶学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-369X
CN:
33-1115/S
开本:
大16开
出版地:
浙江省杭州市梅灵南路9号
邮发代号:
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
1649
总下载数(次)
7
相关基金
浙江省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
http://www.zjnsf.net/
项目类型:
一般项目
学科类型:
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茶叶科学2012年第5期
茶叶科学2012年第4期
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