高粱微卫星分析中遗传完整性样本量的确定

• 作者: 卢新雄 张志娥 朱远英 许玉凤
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 样本量 遗传完整性
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 页码范围: 108-114
• 分类号: S514.03
• 字数: 4222字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.03.021

摘要

采用微卫星分析高粱不同样本量对遗传多样性指数的影响,从而确定最佳样本量,为遗传完整性研究奠定基础.试验设置了10个样本量梯度,对群体的等位基因数目、有效等位基因数目、香农指数、观察杂合度、预期杂合度、多态位点百分数和稀有等位基因频率的变化趋势进行了分析.结果表明,10～40个样本量范围内,等位基因数目、有效等位基因数目、香农指数、多态位点百分数随着样本量的增大而增大；在40个样本量时,等位基因数目、有效等位基因数目和香农指数达到较高值,分别代表了100个群体98.5％的等位基因数、99.1％的有效等位基因数和98.5％的香农指数,之后样本量继续增加,各指标变化不显著.稀有等位基因频率在40个样本量以上,随着样本量的增加数值变化很小.以稀有等位基因频率、等位基因数、有效等位基因数和香农指数为多样性指标,在高粱遗传完整性研究中样本量大小的确定上达到一致性.因此,建议在用SSR技术对高粱进行遗传完整性分析时,样本量要选择40个单株以上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢新雄	中国农业科学院作物科学研究所	38	631	16.0	24.0
2	许玉凤		43	506	14.0	21.0
3	张志娥	中国农业科学院作物科学研究所	8	148	6.0	8.0
4	朱远英		1	11	1.0	1.0