山羊溶酶体α-AMA基因的克隆、生物信息学及组织表达谱分析

• 作者: 孔祥雅 李义 李勤凡 程敏 荆新堂
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: α-甘露糖苷酶 基因克隆 荧光定量PCR 生物信息学 同源建模
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 临床兽医
• 页码范围: 826-831
• 分类号: S852.23
• 字数: 3775字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在对山羊溶酶体α-甘露糖苷酶(α-AMA)基因进行组织表达谱和生物信息学分析.参考牛α-AMA基因序列设计引物,采用PCR技术克隆山羊α-AMA基因序列,并利用荧光定量RT-PCR进行组织表达谱分析以及进行生物信息学预测.首次获得了山羊α-AMA基因,含有完整CDS编码区3000 bp,编码999个氨基酸,其中前50个氨基酸为信号肽序列.其编码区的核苷酸序列和预测氨基酸序列与牛的α-AMA相似性最高,分别为95.93％和94.79％.组织表达谱分析表明α-AMA在山羊各组织均不同程度的表达,其中在肺脏、肝脏、小脑表达量较高.生物信息学预测发现,α-AMA蛋白属于糖苷水解酶38家族成员,有2个保守的结构域,存在9个N-糖基化位点.SWISS-MODEL同源建模山羊α-AMA具有良好的可信度.本研究为探讨酶的作用机理及疯草解毒剂的研制提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔祥雅	西北农林科技大学动物医学院	5	20	2.0	4.0
2	李义	西北农林科技大学动物医学院	7	5	1.0	2.0
3	程敏	西北农林科技大学动物医学院	6	3	1.0	1.0
4	荆新堂	西北农林科技大学动物医学院	5	25	3.0	5.0
5	李勤凡	西北农林科技大学动物医学院	64	455	12.0	18.0