P基因片段测序分析HBV基因分型及耐药位点

• 作者: 刘秀英 叶锋 陈爱英
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝炎病毒,乙型 基因型 序列分析,DNA 拉米夫定 抗药性,病毒
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 726-729
• 分类号: R512.62
• 字数: 2574字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.016

摘要

目的 建立一种高效、准确的HBV基因分型及核苷类药物相关耐药突变位点分析的新方法.方法 2011年7至8月在太原市第三人民医院收集48份乙型肝炎患者血清标本,利用商品化核酸提取试剂盒提取标本DNA,然后分别进行HBV全基因组和P基因片段扩增,最后对产物进行测序分析,通过构建系统发生树和Genotyping软件分析两种方法进行基因分型,并对两种扩增产物的分型结果进行比较.结果 共得到48条HBV全基因组序列,通过构建系统发生树和Genotyping软件分析两种方法确定12条B型序列和36条C型序列；对HBV P基因片段测序产生的序列进行分型,结果与全基因组测序分析完全一致.通过对HBV P基因序列进行分析,共发现7种核苷类药物耐药突变形式,所测标本突变比例达27.1％ (13/48),其中所有突变均与拉米夫定或阿德福韦酯相关,未检测到其他核苷类药物相关耐药突变位点.另外,利用荧光定量PCR法对同样48份标本进行分型检测,共得出B型11例,C型35例,BC混合型2例.结论 乙型肝炎病毒P基因片段测序可能是一种新型乙型肝炎病毒分型方法.同时,该方法还可对核苷类药物相关耐药突变进行分析,为乙型肝炎临床治疗提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶锋		3	19	3.0	3.0
2	陈爱英	太原市第三人民医院检验科	3	11	2.0	3.0
3	刘秀英	太原市第三人民医院检验科	1	3	1.0	1.0